Obowiązek podatkowy określają przepisy prawa podatkowego, ale gdy odwołują się ogólnie lub wprost do innych ustaw, nie jest uzasadnione twierdzenie, że do ustaw tych nie można sięgać, gdyż miałoby to stanowić naruszenie zasady autonomiczności prawa podatkowego.
Brak stosownego zezwolenia Prezesa Narodowego Banku Polskiego na prowadzenie działalności w zakresie udzielania pożyczek powoduje, że spółki prawa handlowego wykonujące jedną z czynności bankowych, o których stanowi art. 11 ust. 1 ustawy z dnia 31 stycznia 1989 r. - Prawo bankowe /Dz.U. 1992 nr 72 poz. 359 ze zm./, nie mogą być uznane za podmioty gospodarcze "prowadzące działalność gospodarczą w zakresie (...) udzielania pożyczek" w rozumieniu art. 68 ust. 2 pkt 2 rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 9 grudnia 1994 r. w sprawie opłaty skarbowej /Dz.U. nr 136 poz. 705/, określającego zakres zwolnienia od tej opłaty.
Naczelny Sąd Administracyjny po rozpoznaniu sprawy ze skargi Przedsiębiorstwa Farmaceutycznego "C-B", Spółki z o.o. w O. na decyzję Izby Skarbowej w O. z dnia 17 lutego 1997 r. (...) w przedmiocie wymiaru opłaty skarbowej od umowy pożyczki - oddala skargę.
Przedsiębiorstwo Farmaceutyczne "C-B", Spółka z o. o. w O. dokonało w latach 1994-1995 między innymi następujących czynności cywilnoprawnych;
1. sprzedaży na rzecz P. Towarzystwa Finansowego "S." w W. obligacji Skarbu Państwa za 24.302.700.000 zł, to jest 2.430,270 zł po denominacji,
2. zakupu od Spółki z o.o. "W.-L." w W. obligacji Skarbu Państwa za 47.700.000 zł, to jest 4.770 zł po denominacji,
3. otrzymało od P. Towarzystwa Finansowego "S." w W. pożyczki w wysokości w sierpniu 1994 r. 120.000.000.000 zł to jest 12.000.000 zł po denominacji oraz w marcu 1995 r. w wysokości 4.000.000 zł,
4. zawarło z P. Towarzystwem Finansowym "S." w W. umowę poręczenia.
W związku ze stwierdzeniem przez inspektora Urzędu Kontroli Skarbowej w O., iż nie została uiszczona od tych czynności opłata skarbowa, w wyniku kontroli z dnia 25 października 1996 r. (...) ustalono opłatę skarbową w łącznej kwocie 368.702,80 zł.
Spółka z o.o. "C-B" w O. złożyła w trybie art. 27 ustawy 2 dnia 28 września 1991 r. o kontroli skarbowej /Dz.U. nr 100 poz. 442 ze zm./ żądanie skierowania sprawy na drogę postępowania w sprawach zobowiązań podatkowych w związku z czym Urząd Skarbowy postępowanie przeprowadził i decyzją z dnia 9 grudnia 1996 r. (...) określił wysokość opłaty skarbowej z tytułu dokonanych przez Spółkę czynności cywilnoprawnych na kwotę 368.702,80 zł.
W odwołaniu od tej decyzji strona zakwestionowała rozstrzygnięcie w części dotyczącej objęcia opłatą skarbową umów pożyczek zawartych z P. Towarzystwem Finansowym "S." w W. zarzucając, że umowy te korzystały ze zwolnienia z opłaty skarbowej zgodnie z par. 68 ust. 2 pkt 2 rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 26 czerwca 1992 r. w sprawie opłaty skarbowej /Dz.U. nr 53 poz. 253 ze zm./ oraz kolejnego rozporządzenia w tej sprawie z dnia 9 grudnia 1994 r. /Dz.U. nr 136 poz. 705/ bowiem udzielone zostały przez podmiot gospodarczy prowadzący działalność w zakresie udzielania pożyczek. Brak zezwolenia Prezesa NBP na udzielenie tych pożyczek nie mógł skutkować niemożnością zastosowania zezwolenia, o którym mowa. Odwoływanie się organu podatkowego do przepisów sprawa bankowego stanowiło naruszenie prawa podatkowego w zakresie opłaty skarbowej, gdyż o zakresie obowiązku podatkowego mogą decydować wyłącznie przepisy prawa podatkowego.
Izba Skarbowa w O. odwołania nie uwzględniła ale decyzją z dnia 17 lutego 1997 r. (...) uchyliła decyzję Urzędu Skarbowego w O. w części i obniżyła wysokość wymierzonej opłaty skarbowej do kwoty 320.097,40 zł stwierdzając, że zgodnie z par. 8 ust. 1 pkt 3 lit. "c" rozporządzenia Rady Ministrów 2 dnia 13 lutego 1992 r. w sprawie właściwości miejscowej organów podatkowych /Dz.U. nr 16 poz. 62 ze zm./ Urząd Skarbowy w O. nie był właściwy do orzekania w sprawie wymiaru opłaty skarbowej w kwocie 48.605.40 zł od umów sprzedaży obligacji Skarbu Państwa, w których Spółka z o.o. "C-B" była stroną sprzedającą, zgodnie bowiem z tym przepisem właściwym miejscowo organem podatkowym dla tego rodzaju czynności był urząd skarbowy według miejsca zamieszkania lub siedziby nabywcy. Odnośnie opodatkowania opłatą skarbową umów pożyczek podzielono stanowisko organu podatkowego I instancji.