kwoty 100.000.000,- złotych za badanie bilansu P.P. Z. P. - w likwidacji;
kwoty 447.268.000,- złotych z tytułu składek na ubezpieczenie społeczne, Fundusz Pracy oraz Fundusz Gwarantowanych Świadczeń Pracowniczych od wypłaconych nagród z zysku zlikwidowanego P.P. Z. P.;
kwoty 120.339.500,- stanowiącej spłatę części zobowiązań wobec firmy "J. K. I. L." wynikających z faktury wystawionej dla P.P. Z. P.;
kwoty 73,371.000,- złotych dotyczącej podatku należnego od towarów i usług z faktur wystawionych w m-cach lipcu i sierpniu 1994 r. przez P.P. Z. P., nie opłaconego przez kontrahentów.
Wyżej wymienione wydatki nie stanowiły kosztów uzyskania przychodu w rozumieniu przepisów art. 15 ust. 1 ustawy.
3) wykazania straty w obrocie papierami wartościowymi w wyniku dokonanych przez Z. P. Sp. z o.o. w B. w m-cu grudniu 1994 r. czynności prawnych (umowy agencyjnej, umowy pożyczki, umowy zakupu i sprzedaży) związanych z obrotem obligacjami W. L. Sp. z o.o. w W. i obligacjami Skarbu Państwa Rzeczypospolitej Polskiej - 3 % Państwowej Renty Ziemskiej II serii z 1 czerwca 1936 r. Zdaniem organu podatkowego, podejmowane przez Spółkę czynności w zakresie obrotu obligacjami W. L. Sp. z o.o., a także związane z tym wzajemne rozliczenia zobowiązań, udzielania i spłaty pożyczek z firmami: P. T. F. "S." Sp. z o.o. w W., PTE "S.", PHP "P." miały na celu obejście przepisów art. 7 ust. 1, art. 12 ust. 1 oraz art. 15 ust. 1 ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych. W związku z tym, że powyższe poczynania miały na celu obejście przepisów podatkowych, umowy zawierane w tym zakresie przez Spółkę były nieważne w świetle przepisów art. 58 ( 1 w zw. z art. 353 Kodeksu cywilnego. Dlatego też przy ustalaniu dochodu Spółki stanowiącego podstawę opodatkowania organ podatkowy nie uwzględnił zarówno przychodów jak i poniesionych kosztów dotyczących obrotu obligacjami W. L. Sp. z o.o. Strata na transakcjach obrotu obligacjami W. L. wyniosła 9.979.800.000 st. zł nie mogła ona obciążać wyników Spółki za 1994 rok. Natomiast przy ustalaniu dochodu stanowiącego podstawę opodatkowania organ uwzględnił obrót akcjami tj. zarówno przychody jak i koszty stwierdzając, że wynik (zysk) 7.188.000.000,- zł podlegał opodatkowaniu, chociaż nie został przez Spółkę opodatkowany.
Dokonując powyższych korekt, w stosunku do kwot wykazanych przez Spółkę, organ określił należny podatek dochodowy za 1994 rok w kwocie 22.171.296.000 zł i po uwzględnieniu kwoty zadeklarowanej i wpłaconej przez Spółkę - 1.367.080.000 st. zł, różnicę do przypisu i wpłaty określono na kwotę 20.804.216.000 st. zł (po denominacji - 2.080.421,60 zł). Wyliczono odsetki na łączną kwotę 4.987.511,50 zł.
Odwołując się od powyższej decyzji Spółka zarzucała, że zawarte w niej rozstrzygnięcie narusza przepisy art. 2 ust. 1 pkt 3, art. 11 ust. 1 i art. 15 ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych; art. 58 w zw. z art. 65 ( 2 i 353 Kodeksu cywilnego;
art. 121 i 125 Ordynacji podatkowej. Spółka wnosiła o uchylenie zaskarżonej decyzji i przekazanie sprawy do ponownego rozpatrzenia organowi pierwszej instancji. Ustosunkowując się do twierdzeń organu podatkowego zawartych w uzasadnieniu decyzji wyjaśniała: