Naczelny Sąd Administracyjny w składzie: Przewodniczący: Sędzia NSA Grzegorz Krzymień (sprawozdawca), Sędziowie NSA: Krystyna Nowak, Jan Grzęda, Protokolant Magdalena Gródecka, po rozpoznaniu w dniu 30 sierpnia 2007 r. na rozprawie w Izbie Finansowej skargi kasacyjnej Dyrektora Izby Skarbowej w W. od wyroku Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego w Warszawie z dnia 30 maja 2005 r., sygn. akt III SA/Wa 2453/04 w sprawie ze skargi Jacka S. na decyzję Dyrektora Izby Skarbowej w W. z dnia 29 października 2004 r. (...) w przedmiocie odmowy stwierdzenia nadpłaty w podatku dochodowym od osób fizycznych za 2001 r. oddala skargę kasacyjną.
Wyrokiem z dnia 30 maja 2005 r., sygn. akt III SA/Wa 2453/05, Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie, po rozpoznaniu skargi Jacka S. uchylił decyzję Dyrektora Izby Skarbowej w W. z dnia 29 października 2004 r. w przedmiocie nadpłaty w podatku dochodowym od osób fizycznych za 2001 r. W uzasadnieniu orzeczenia wskazano, iż pismem z dnia 20 maja 2004 r. Skarżący zwrócił się do organu podatkowe I instancji o stwierdzenie nadpłaty w podatku dochodowym od wynagrodzenia z tytułu pełnienia służby wojskowej na ostatnio zajmowanym stanowisku służbowym w kraju w czasie pełnienia służby poza jego granicami w Polskim Kontyngencie Wojskowym. Odmawiając stwierdzenia nadpłaty organy podatkowe powołując się na brzmienie art. 21 ust. 1 pkt 83 ustawy z dnia 26 lipca 1991 r. o podatku dochodowym od osób fizycznych /tekst jednolity z 2000 r., Dz.U. 14, poz. 176 ze zm./, dalej w skrócie "p.d.o.f." - w brzmieniu obowiązującym w 2001 r. - stwierdziły, iż zastosowanie powyższego zwolnienia uzależnione było zatem od spełnienia łącznie dwóch przesłanek: wypłacone należności pieniężne musiały być bezpośrednio związane z użyciem wymienionych w powołanym przepisie osób poza granicami państwa oraz należności te musiały wynikać z celów określonych w zwolnieniu. Dyrektor Izby Skarbowej w W. podkreślił, iż w § 3 i § 15 rozporządzenia Rady Ministrów z dnia 5 grudnia 2000 r. w sprawie uposażenia i innych należności pieniężnych otrzymywanych przez żołnierzy wyznaczonych do pełnienia służby poza granicami państwa /Dz.U. nr 115, poz. 1198 ze zm./ określono rodzaje należności pieniężnych wypłacanych tytułem pełnienia służby poza granicami kraju, które na mocy art. 21 ust. 1 pkt 83 p.d.o.f. podlegały zwolnieniu z opodatkowania. Wypłacone Skarżącemu uposażenie stanowiło wyłącznie wynagrodzenie ze stosunku służbowego wiążącego go z macierzystą jednostką wojskową i nie wynikało bezpośrednio z pełnienia przez niego służby poza granicami kraju, a zatem - w ocenie organu podatkowego - nie podlegało zwolnieniu z opodatkowania.
Uchylając decyzję Dyrektora Izby Skarbowej Sąd I instancji podkreślił, iż w 2001 r. z art. 21 ust. 1 pkt 83 p.d.o.f. wynikało, że wolne od podatku dochodowego są należności pieniężne wypłacone osobom wymienionym w przepisie, jeżeli służyły lub pracowały poza granicami państwa w celach również wymienionych w przepisie. Przepis ten w żaden sposób nie rozgraniczał wypłacanych należności pieniężnych, nie wskazywał, iż muszą one pozostawać w bezpośrednim i wyłącznym związku z pełnioną służbą, nie było więc podstaw prawnych - w ocenie Sądu I instancji - by twierdzić, że należności przysługujące żołnierzom pełniącym zawodową służbę wojskową poza granicami państwa z tytułu pełnienia dotychczasowych obowiązków w kraju nie podlegały zwolnieniu z opodatkowania na podstawie cytowanego przepisu. W uzasadnieniu wyroku wskazano również, iż omawiany przepis otrzymał brzmienie, jakie usiłowały mu nadać organy podatkowe w rozpoznawanej sprawie, dopiero z dniem 1 stycznia 2003 r., kiedy to weszła w życie ustawa z dnia 27 lipca 2002 r. o zmianie ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych oraz o zmianie niektórych innych ustaw /Dz.U. Nr 141, poz. 1182/. Zmiany tej Sąd I instancji nie uznał jednak za doprecyzowanie istniejącego unormowania, lecz za nową regulację omawianego zwolnienia podatkowego.